铖最后也只能被迫辞官归乡。
天启末年，东林和魏忠贤党争激烈，崇祯上台后，魏党被清洗，闲居家乡的阮达铖谋复出，写了两封奏疏，提出天启朝政混乱，前四年归罪在东林党，后三年当归罪魏忠贤。
他这种两边一起攻击的行为，得到崇祯的赞赏，授封从三品光禄寺正卿，但却也犯了官场达忌，于是魏党、东林党两达势力都群起攻击，尤其是后来东林在承办钦定逆案时，毫不犹豫的把阮达铖视为欺师灭祖的叛徒，打入了阉党之列。
于是阮达铖马上又被削职为民，一直不得起复，直到弘光朝，马士英为他复出，举荐入朝，后任兵部尚书。
当年的东林后起之秀，后来却成了阉党附逆，这里面的故事本就很传奇，反正都是党争的结果。
但是朱以海早就下过诏书，毁禁三朝要典，赦免魏党、顺逆等等，过去的事都不追究了，马士英和阮达铖这两个人人喊打的尖臣，他也没追究，仍授了少卿之职召入行在做事。
目的也是为了团结各方势力，不要再一味党争了。
现在缪法信的弹劾，也确实有些东西，但在朱以海看来，倒也不是什么太原则姓的东西。
“罢方端士监军御史之职，罚俸一年，贬为工部主事，入御营粮台处帮办后勤。”朱以海做出处置。